Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
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NipblQ6KCD5 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
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NipblQ6KCD5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
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NipblQ6KCD5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
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NipblQ6KCD5 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
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NipblQ6KCD5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
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NipblQ6KCD5 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
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NipblQ6KCD5 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
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NipblQ6KCD5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
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NipblQ6KCD5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
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NipblQ6KCD5 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
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