Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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