Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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