Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6DFW0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6DFW0 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms