Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fndc3c1Q6DFV6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc3c1Q6DFV6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms