Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms