Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trim58Q5NCC9 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trim58Q5NCC9 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trim58Q5NCC9 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trim58Q5NCC9 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trim58Q5NCC9 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trim58Q5NCC9 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trim58Q5NCC9 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trim58Q5NCC9 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trim58Q5NCC9 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trim58Q5NCC9 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trim58Q5NCC9 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trim58Q5NCC9 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Trim58Q5NCC9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim58Q5NCC9 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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