Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Kdm5aQ3UXZ9 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Kdm5aQ3UXZ9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Kdm5aQ3UXZ9 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm5aQ3UXZ9 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms