Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC8□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms