Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctsll3Q3ULP7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms