Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
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Rnf40Q3U319 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Rnf40Q3U319 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Gm10419-201ENSMUST00000100944 1671 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Rnf40Q3U319 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Rnf40Q3U319 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Rnf40Q3U319 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Rnf40Q3U319 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Rnf40Q3U319 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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