Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms