Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cers3Q1A3B0 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms