Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Ttc39dQ0VF76 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Ttc39dQ0VF76 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Ttc39dQ0VF76 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Ttc39dQ0VF76 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
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Ttc39dQ0VF76 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ttc39dQ0VF76 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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