Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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