Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Snrpd1P62315 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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Snrpd1P62315 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Snrpd1P62315 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Snrpd1P62315 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Snrpd1P62315 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Snrpd1P62315 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Snrpd1P62315 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Snrpd1P62315 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Snrpd1P62315 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Snrpd1P62315 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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