Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms