Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrp1P56183 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms