Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rfx1P48377 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rfx1P48377 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rfx1P48377 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rfx1P48377 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rfx1P48377 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rfx1P48377 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rfx1P48377 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rfx1P48377 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rfx1P48377 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rfx1P48377 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rfx1P48377 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rfx1P48377 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rfx1P48377 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rfx1P48377 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfx1P48377 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfx1P48377 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfx1P48377 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rfx1P48377 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfx1P48377 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfx1P48377 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfx1P48377 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfx1P48377 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfx1P48377 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfx1P48377 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfx1P48377 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfx1P48377 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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