Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VdrP48281 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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