Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SrprbP47758 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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SrprbP47758 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SrprbP47758 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrprbP47758 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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