Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbP41155 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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LtbP41155 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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LtbP41155 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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LtbP41155 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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