Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Nedd1P33215 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Nedd1P33215 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Nedd1P33215 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Nedd1P33215 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Nedd1P33215 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Nedd1P33215 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Nedd1P33215 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Nedd1P33215 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms