Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SsbP32067 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SsbP32067 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SsbP32067 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SsbP32067 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SsbP32067 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SsbP32067 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SsbP32067 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SsbP32067 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SsbP32067 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SsbP32067 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SsbP32067 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SsbP32067 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SsbP32067 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SsbP32067 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SsbP32067 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SsbP32067 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SsbP32067 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SsbP32067 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SsbP32067 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SsbP32067 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms