Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CtsdP18242 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CtsdP18242 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms