Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms