Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms