Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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