Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
BckdkO55028 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
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