Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajb6O54946 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajb6O54946 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms