Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2O35245 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms