Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.6 ms