Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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