Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp6G5E8P0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms