Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Nccrp1G3X9C2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Nccrp1G3X9C2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Nccrp1G3X9C2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Nccrp1G3X9C2 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Nccrp1G3X9C2 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nccrp1G3X9C2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms