Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.4 ms