Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CK137956B1AYM9 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CK137956B1AYM9 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CK137956B1AYM9 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CK137956B1AYM9 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CK137956B1AYM9 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CK137956B1AYM9 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CK137956B1AYM9 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CK137956B1AYM9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CK137956B1AYM9 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CK137956B1AYM9 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CK137956B1AYM9 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CK137956B1AYM9 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CK137956B1AYM9 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CK137956B1AYM9 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CK137956B1AYM9 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CK137956B1AYM9 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CK137956B1AYM9 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CK137956B1AYM9 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CK137956B1AYM9 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CK137956B1AYM9 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms