Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ckap5A2AGT5 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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