Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubl3Q9Z2M6 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms