Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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