Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Usp29Q9ES63 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Usp29Q9ES63 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Usp29Q9ES63 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Usp29Q9ES63 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Usp29Q9ES63 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Usp29Q9ES63 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Usp29Q9ES63 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Usp29Q9ES63 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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Usp29Q9ES63 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Usp29Q9ES63 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Usp29Q9ES63 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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