Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tlr1Q9EPQ1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms