Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Bco2-201ENSMUST00000119103 2118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 B3gntl1-202ENSMUST00000067399 2864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Slc16a7-201ENSMUST00000063318 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 D130040H23Rik-204ENSMUST00000212549 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Mill2-206ENSMUST00000228493 2043 ntAPPRIS P4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Csf3r-201ENSMUST00000030673 3160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Plk4-201ENSMUST00000026858 3479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Rimbp2-202ENSMUST00000196085 3732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Sez6l-203ENSMUST00000197425 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Pla2g6-210ENSMUST00000174021 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Brip1os-202ENSMUST00000143819 2604 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Pla2g16-201ENSMUST00000025925 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Snx31-201ENSMUST00000013755 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arpc5lQ9D898 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms