Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms