Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkrip1Q9CWV6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms