Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PompQ9CQT5 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms