Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Atp5f1Q9CQQ7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Atp5f1Q9CQQ7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Atp5f1Q9CQQ7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Atp5f1Q9CQQ7 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atp5f1Q9CQQ7 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atp5f1Q9CQQ7 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atp5f1Q9CQQ7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atp5f1Q9CQQ7 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atp5f1Q9CQQ7 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Atp5f1Q9CQQ7 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5f1Q9CQQ7 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Atp5f1Q9CQQ7 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.9 ms