Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Cldn16Q925N4 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Cldn16Q925N4 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Cldn16Q925N4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Cldn16Q925N4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Cldn16Q925N4 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Cldn16Q925N4 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Cldn16Q925N4 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Cldn16Q925N4 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Cldn16Q925N4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Cldn16Q925N4 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Cldn16Q925N4 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Cldn16Q925N4 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Cldn16Q925N4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Cldn16Q925N4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Cldn16Q925N4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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