Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Med28Q920D3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms