Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rdh13Q8CEE7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms